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浙江中醫(yī)藥大學第二臨床醫(yī)學院前身是籌建于2000年4月的浙江中醫(yī)學院醫(yī)學系（籌），2004年7月正式組建浙江中醫(yī)學院醫(yī)學系，與附屬第二醫(yī)院（浙江省新華醫(yī)院）實行“院系合一”的辦學模式。

2006年2月浙江中醫(yī)學院更名為浙江中醫(yī)藥大學，2006年5月，醫(yī)學系隨即更名為浙江中醫(yī)藥大學第二臨床醫(yī)學院。第二臨床醫(yī)學院（直屬附屬第二醫(yī)院）現(xiàn)有教職員工1064人，其中高級職稱153人，現(xiàn)有碩士生導師182人，博士生導師20人，現(xiàn)擁有國家重點臨床專科建設項目2個（風濕病科、外科），國家中醫(yī)藥管理局重點學科建設項目3個（中醫(yī)痹病學、中醫(yī)全科醫(yī)學、中醫(yī)預防醫(yī)學），國家中醫(yī)藥局重點?？平ㄔO和培育項目6個（風濕病科、肝病科、骨質(zhì)疏松癥、肺病科、外科學、護理學），省中醫(yī)藥重點學科2個，省中醫(yī)藥重點學科建設項目3個，省中醫(yī)藥重點?？平ㄔO項目5個，學科建設經(jīng)費達1430萬元；在科學研究方面，醫(yī)院先后承擔了國家級項目14項，省部級項目44項，廳（局）級科研項目近300項，獲得各級科技成果獎勵近40項次，其中國家科技進步獎二等獎1項，中華中醫(yī)藥學會科學技術(shù)獎1項，浙江省科學技術(shù)獎11項，各類廳局級獎勵19項。SCI收入文章13篇。2014年，學院臨床醫(yī)學專業(yè)通過國家教育部臨床醫(yī)學專業(yè)認證，認證期限為5年，并在同年申請立項“省級新興特色專業(yè)”成功。

學院堅持“以學生為中心”的辦學思想，遵循“醫(yī)德教育為先導，能力培養(yǎng)為重點，素質(zhì)提升為核心，崗位勝任為目標”的辦學理念，著力培養(yǎng)具有良好的思想道德和職業(yè)素養(yǎng)，具備初步的臨床能力、終身學習能力和進一步深造的基礎，能在基層衛(wèi)生保健機構(gòu)上級醫(yī)師的指導與監(jiān)督下，提供安全有效醫(yī)療實踐的應用型人才。力爭將臨床醫(yī)學專業(yè)建設成為具有較高人才培養(yǎng)質(zhì)量和良好社會聲譽，符合浙江省衛(wèi)生事業(yè)和經(jīng)濟社會發(fā)展需要的特色專業(yè)。

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